Penyusunan rencana strategis (Renstra) MAYOGA menghasilkan tujuan jangka menengah yang ditargetkan tercapai hingga tahun 2014. Selama lima tahun, ada beberapa hal penting mesti dicapai.
Pertama, dokumen KTSP seluruh tingkat lengkap tersedia dan siap pakai.
Kedua, tingkat kelulusan 100%.
Ketiga, peningkatan skor GSA (Gain Score Achievement = selisih nilai output dan input) mencapai minimal + 2,0.
Keempat, pada tahun 2013, tamatan MAN YOGYAKARTA III yang diterima di PTN melalui jalur PBUD, PBAD, UM dan SPMB mencapai minimal 80%.
Kelima, 100% guru memanfaatkan teknologi informasi dalam pembelajaran.
Keenam, tim olimpiade sains MAYOGA berprestasi pada tingkat provinsi.
Ketujuh, kelompok KIR mampu berprestasi di tingkat nasional.
Kedelapan, kegiatan ekstrakurikuler mampu berprestasi di tingkat nasional.
Kesembilan, memiliki Kelompok Debat Bahasa Inggris yang menjadi finalis tingkat nasional.
Kesepuluh, memiliki Tim Olahraga minimal 3 cabang yang mampu menjadi finalis (juara) tingkat provinsi
Kesebelas, memiliki tim kesenian yang berprestasi di tingkat provinsi.
Kedua belas, terwujud MAN Yogyakarta III sebagai sekolah berwawasan lingkungan sehingga mendukung kegiatan pembelajaran yang kondusif.
Ketiga belas, meningkatkan kualitas pengelolaan program Sekolah Sehat.
Keempat belas, fasilitas ICT dapat dimaksimalkan untuk keberhasilan KBM (Minimal 5 mata pelajaran yang telah mengujicobakan e-learning).
Kelima belas, meningkatkan kompetensi yang tinggi dalam setiap mata pelajaran.
Keenam belas, meningkatkan peran serta komite sekolah sebagai mitra sekolah dalam pengembangan mutu.
Ketujuh belas, Unit Produksi Ketrampilan dapat eksis memiliki prestasi produk. Semoga sukses![Suk]
